Jejich úkolem monitorovat výskyt nejčastějších původců nemocí v daném regionu. Mají být schopny poradit i ve složitých a sporných případech. Jsou i místy, kde by měla být okamžitě k dispozici i vzácná a často život zachraňující antibiotika (v nočních hodinách či o víkendech).

Antibiotiková centra jsou i jakýmisi strážci financí. Jestliže je totiž antibiotikum nasazeno skutečně správně (například podle výsledků kultivace), tak se ušetří peníze například za kratší dobu hospitalizace nebo se nemusí měnit již nasazená léčba.